Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Nek9Q8K1R7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Nek9Q8K1R7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Nek9Q8K1R7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Nek9Q8K1R7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Nek9Q8K1R7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Nek9Q8K1R7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Nek9Q8K1R7 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Nek9Q8K1R7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek9Q8K1R7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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