Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Afg3l2Q8JZQ2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Afg3l2Q8JZQ2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Afg3l2Q8JZQ2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Afg3l2Q8JZQ2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Afg3l2Q8JZQ2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Afg3l2Q8JZQ2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms