Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbsnQ8CIT9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms