Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc178Q8CDV0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms