Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccdc73Q8CDM4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccdc73Q8CDM4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccdc73Q8CDM4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccdc73Q8CDM4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc73Q8CDM4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc73Q8CDM4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc73Q8CDM4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc73Q8CDM4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc73Q8CDM4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc73Q8CDM4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc73Q8CDM4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc73Q8CDM4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc73Q8CDM4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc73Q8CDM4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc73Q8CDM4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc73Q8CDM4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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