Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms