Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc27Q8CD92 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms