Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim35Q8C006 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim35Q8C006 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim35Q8C006 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim35Q8C006 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim35Q8C006 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim35Q8C006 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim35Q8C006 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim35Q8C006 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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