Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms