Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms