Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod1Q8BVA4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms