Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Tubgcp5Q8BKN5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Tubgcp5Q8BKN5 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Tubgcp5Q8BKN5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Tubgcp5Q8BKN5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Tubgcp5Q8BKN5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tubgcp5Q8BKN5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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