Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms