Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms