Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms