Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST3

Samd10, Sterile alpha motif domain-containing protein 10, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd10Q7TST3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Samd10Q7TST3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Samd10Q7TST3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms