Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ube2q1Q7TSS2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube2q1Q7TSS2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms