Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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