Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Vma21Q78T54 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Vma21Q78T54 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vma21Q78T54 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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