Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm29Q6PDI5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm29Q6PDI5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm29Q6PDI5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm29Q6PDI5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm29Q6PDI5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm29Q6PDI5 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms