Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp49Q6P9L4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms