Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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