Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2B1

Tnpo3, Transportin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo3Q6P2B1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnpo3Q6P2B1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms