Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sohlh1Q6IUP1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sohlh1Q6IUP1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sohlh1Q6IUP1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sohlh1Q6IUP1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sohlh1Q6IUP1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sohlh1Q6IUP1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sohlh1Q6IUP1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sohlh1Q6IUP1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sohlh1Q6IUP1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sohlh1Q6IUP1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sohlh1Q6IUP1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sohlh1Q6IUP1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Sohlh1Q6IUP1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sohlh1Q6IUP1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sohlh1Q6IUP1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sohlh1Q6IUP1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sohlh1Q6IUP1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms