Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Krt40Q6IFX3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms