Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rftn1Q6A0D4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms