Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Msl2Q69ZF8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Msl2Q69ZF8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Msl2Q69ZF8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Msl2Q69ZF8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Msl2Q69ZF8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Msl2Q69ZF8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Msl2Q69ZF8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Msl2Q69ZF8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msl2Q69ZF8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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