Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms