Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms