Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2bQ64511 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms