Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms