Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trim24Q64127 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trim24Q64127 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim24Q64127 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms