Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms