Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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Rbm38Q62176 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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Rbm38Q62176 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbm38Q62176 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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