Protein–RNA interactions for Protein: Q61985

Nfe2l1, Endoplasmic reticulum membrane sensor NFE2L1, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l1Q61985 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nfe2l1Q61985 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nfe2l1Q61985 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nfe2l1Q61985 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nfe2l1Q61985 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nfe2l1Q61985 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nfe2l1Q61985 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms