Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcd2Q61285 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms