Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms