Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cnot7Q60809 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cnot7Q60809 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cnot7Q60809 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cnot7Q60809 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot7Q60809 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot7Q60809 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot7Q60809 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot7Q60809 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot7Q60809 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot7Q60809 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Cnot7Q60809 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Cnot7Q60809 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Cnot7Q60809 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cnot7Q60809 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cnot7Q60809 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot7Q60809 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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