Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Samhd1Q60710 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms