Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prdm1Q60636 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms