Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trim38Q5SZ99 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms