Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms