Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim58Q5NCC9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim58Q5NCC9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 272.9 ms