Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms