Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms