Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ckap2Q3V1H1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms