Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prdm6Q3UZD5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Prdm6Q3UZD5 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms