Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shisa3Q3UPR0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shisa3Q3UPR0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms