Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms