Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U595 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U595 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U595 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U595 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U595 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U595 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U595 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U595 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U595 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U595 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U595 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U595 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U595 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U595 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U595 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U595 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U595 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U595 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U595 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U595 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U595 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U595 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U595 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U595 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U595 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U595 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U595 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U595 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U595 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U595 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U595 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U595 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U595 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U595 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms